Black Rhinoゲノムのシークエンシングは絶滅から種を救うことができる

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Anonim

21世紀は生物工学者になるための素晴らしい時であり、黒いサイであるための恐ろしい時です。 1世紀前に85万の番号を付けられたアフリカの種は、およそ5,000の人口が急速に減少しています。いつかこの壊滅的な衰退を巻き戻してくれることを期待して、生物学者たちはそのシーケンスをクラウドソーシングしようとしています。 diceros bicornis bicornis ゲノム。

このプロジェクトは、ワシントン大学の病理学者でバイオエンジニアであるDr. Charles Murrayと、PembientのCEOであるMatthew Markusを含む、いくつかの保全志向のバイオテクノロジー専門家の共同作業です。 Pembientはサンフランシスコのバイオテクノロジー企業であり、中国製の市場に合成の、しかし生物学的には同一のサイホーンを実験用のケラチンから印刷され、おそらくサイのビールとして出荷されています。 (ケラチンはあなたの指の爪とサイの角が作られているものです。それは魔法でも薬でもありません。)ペンビエントはNtombiと名付けられた単一のサイのゲノムから十分に学ぶことができた 逆 、それはサイタンパク質を合成する方法を洗練するために。

しかし、誰かがデータのためにNtombiの遺伝学を採掘することができる前に、黒いサイのゲノムは最初に配列決定されなければなりません。このプロジェクトは、長年のビデオゲームを復活させるのではなく、科学を除けばKickstarterのようなクラウドファンディングプラットフォームのExperiment.comで$ 16,500を集めることになっている。

「ゲノムの配列が決定された生物はまだ比較的少数です」とMurray氏は言います。 「ごく最近まで、これは非常に困難でした。時間がかかり、高価です。」

動物がゲノムを完成させているわけではないというわけではありません。ゲノム10Kプロジェクトは、ノアの箱舟の遺伝データの収集を目的としています。そして、より人口の多い、より大型の種である南部のシロサイは、2012年にそのゲノムの配列が決定されました。しかし、Ntombiのような黒いサイはどうですか? 「黒いサイがそんなに長い間横に放置されてきた理由は明らかではありません」とMarkusは言います。彼はその省略を偶然にまで挑戦します。しかし、南部の白人はすでに順序付けられていたので、黒いサイは優先されていなかったのかもしれません。

Markus、Murray、そして彼らの共同研究者たちはそのギャップを埋めることを目指しています。このプロジェクトのポスターサイであるNtombiはすでに採血され保存されています - そして、ビンゴ! Rhino DNAシーケンスはかなり簡単なはずです、とMurrayは言いました。 「シロサイのゲノムをベンチマークとして使用することは大きな助けになります。」

シーケンスの次のステップ

NtombiのDNAがDNAnexsusのサーバー上でホストされているので、生物学者たちは比較Rhinoゲノミクスの基礎を築くでしょう。 「彼女のシーケンスがわかれば、サイとサイの関係、白と黒の違いを理解し始めることができます」とMurray氏は言います。

獣医師は、潜在的な病気の原因となる遺伝子をチェックし、他の7つのクロサイ亜種を比較するためのベースラインを持つことができます - そのうち3つはすでに絶滅しています。

明後の動物

クロサイの遺伝学についての理解が深まると、いくつかの理論的な扉が開かれます。 「道を進んで行くと、サイの生理機能を理解するために、そして潜在的には、密猟を減らすためにサイの角を成長させるために幹細胞を使用することに興奮しています」とMurrayは言います。

Markusはもう少し予後予測します。にとって diceros bicornis bicornis マーカスはそれほど多くのマンモススタイルの絶滅を想定していないが、遺伝時計を巻き戻している。人口が少なくなればなるほど、彼らは問題を受け継ぎやすくなります。

そして消えている黒いサイのために?彼はこの努力をサンディエゴ動物園で進行中のプロジェクトであるノーザンシロサイゲノムの配列決定の努力と比較しています。南部のシロサイ(そのうち2万人)に、北部のシロサイ(そのうち5人)を任期に連れて行かせるという話があります。 Markusは慎重に、慎重に楽観的に語っています。「潜在的に - おそらく - おそらく消滅しているクロサイ亜種は再び命を吹き込まれる可能性があります。」

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